乌丸莲耶被捕后,组织内部的矛盾彻底激化，再加上卧底们和被暗中策反的水货们拼命地搅混水，哪怕后来琴酒和朗姆都发现了其中的不对劲,再补救也来不及了。
有了福尔摩斯提供的名单，仅仅三个月,黑衣组织的高层几乎尽数落网，包括平时被组织藏得很深的那些研究人员。
在针对朗姆的抓捕行动中，掺了水的贝尔摩德协助有功,所以警方并没有以她是黑衣组织成员这个理由逮捕她,只是有了这个秘密案底，她以后的生活也会陷入监管之中。至此，除了琴酒逃脱围捕至今在逃外,黑衣组织的高层基本上被一网打尽,就连混在高层里面的各国卧底，都有因为知道的还不够多而差点把别国卧底干掉的。
这棵盘踞在世界各地半个世纪之久、在阴暗处吞噬了无数人的巨树,此刻终于如倾塌的大楼般被伐倒。
毫不知情的人们一如往日过着或快乐或颓废的生活,没有人知道曾有这么一个庞然大物在他们未知的角落消亡，酒吞童子的百鬼夜行造成的混乱似乎也并没有对大众的生活造成什么影响。
……是该这样的,他不是早就猜到了吗？
从同事口中听说在百鬼夜行那天街上出现了一伙以破坏和杀戮为教义的邪教组织,那场百鬼夜行中被怪物杀害的人在他人口中成了邪教成员刀下的亡魂,而为维护秩序对抗百鬼夜行而牺牲的警察们,死在了对抗□□徒的斗争里。
——在特异点中死去的人不会再活过来,于是他们在世人眼中以常世的方式死去。
真相被封存在仅有的几个近距离接触过魔术这个密辛的人脑海里,这些警察们举行葬礼的时候，他因为组织还没有被攻破而无法去参加,甚至也不能做出任何亲近他们的举动,但是在组织已经基本破灭、只剩那么几个人在逃的现在,他已经可以光明正大地去墓地看望这些统一战线上的同事们了。
云层渐散，阳光从天际洒下，透过层层叠叠的枝叶，洒下一层碎金。
天开了，云散了，终于有这么一天，他再次站在了阳光之下。
随着黑衣组织的毁灭，潜伏在组织里的卧底们和暴露身份后游离在外的卧底们，都回到了自己真正所在的组织。一直隐藏在暗处的诸伏景光也终于恢复了自己警察的身份，光明正大地和警视厅的同事们打起了招呼。
这天，休沐的诸伏景光回长野看望自己哥哥的时候，忽然在路上听到旁边的店里传来广告的声音——
【惊爆！新晋少女漫画家竟是当年忽然隐退的知名漫画家！】
诸伏景光下意识回头一看，只见店里一个小女孩正在看一台放在店里的小电视，上面的配图正是罗曼本人。
电视声音并不大，只是他耳力好并且离得近，才听到了电视里的声音。
罗曼的漫画在上一周刚刚进入完结篇，只不过因为会社公开了「草莓蛋糕」就是「dr草莓」的事，导致他这段时间特别火。
他现在最大的乐趣之一就是看罗曼的漫画放松，毕竟没有哪一部漫画里面能同时迫害琴酒、他的幼驯染降谷零、曾经的黑麦威士忌现在的赤井秀一、在公安和fbi之间左右逢源的江户川·工藤新一·柯南，以及他的同期松田阵平。甚至赤井秀一还被迫害了两次！
虽然漫画里那个女警官的眼型好像有点像自己，但比起松田的卷毛，果然还是对方的明显多了吧！
新的剧情里银子已经通过卢托的帮助从fbi的审讯室逃了出来，但是曾经被fbi抓到过的银子已经不再像过去那样备受首领信赖，首领担心她向fbi吐露了什么组织的情报，派人带去问了不少次话。
——这个问话的对象地位很高，长得有点丑，还镶着一只义眼，一看就知道是在向朗姆致敬。
卢托这次不仅救人成功，还给fbi造成了巨大损失（看到这一段的降谷零狠狠地点了个赞），由此彻底进入的boss的视线，地位随之水涨船高。
相对的，被脱逃中的银子和卢托逮着怼的黑井秀人这次身受重伤，在银子被首领以新的任务的名义打发到日本的时候，他十分坚忍地带着伤暗中跟到了日本，再次与高中生侦探黑羽柯南搭上了关系。
在一系列的推理漫剧情之后，黑羽柯南成功晋级成了银子的新任宿敌。
在最新的一话中，黑羽柯南和黑井秀人在无数的线索中推理出了组织首领的真实身份，并锁定了首领所在的大致位置。
为了彻底解决组织的首领，日本公安与fbi难得合作，布下了针对组织首领的天罗地网。
事情发展到这个地步，为了抵抗红方势力的追捕，作为组织1的银子再次被重用，被首领投放到了抵抗的前线，借助基地复杂的地形且战且退为首领断后。而作为组织新贵的卢托则被首领安排在自己身边保护自己。
以主角的视角来看，银子的处境相当危险——前方火力猛烈，人数众多，而己方人数不多不说，守在监控室为她提供敌方人员位置的人都有退缩之意。终于，在附近的监控摄像头都被破坏之后，守着监控提供线索的人彻底放弃治疗断开了通话连接。
还挡在前线断后的银子唾骂了一声，慢慢地后退——在首领没有下达可以撤退的命令之前，忠诚于组织的杀手就必须将红方的人的挡下来。