很快，上杉、六角两军就在千贺原展开大战。
但经过几回合的交
战下来，六角军很快就被上杉军压制，最终志村资则、加藤将监、植田光次等尹贺诸将先后被上杉军所讨取，而六角军残余各部也是兵疲力尽，濒临崩溃。
就在这时，突然东风大起，六角军本阵的旗帜、马印或被刮倒，或被折断。
六角义治顿时心生退意，便准备下令各部退回尹贺、近江两国的境目地带，准备在群山之中继续与上杉军纠缠。
可六角义治还没来得及下令撤军之际，左武义昌、的场昌长等杂贺众已经迂回至六角军本阵的侧翼，朝着六角义治的方向用铁炮集火射击，随即集中了六角义治的左臂。
六角义治麾下的马廻众急忙将六角义治扶起，向着北尹贺菊永城疾驰而逃，完全不顾其余六角军各部的死活。
在六角义治逃离战场后，就只剩下六角贤永、管秀政、黑川玄蕃左、河井公左卫门、木户小太郎等南近江出身的六角家武将还在继续奋战。
尽管六角军一度与上杉军打得不分伯仲，但在左武义昌、的场昌长等杂贺众的铁炮集火之下措不及防，阵势大乱，很快就失去了战斗能力而四散而逃。
直江重纲、篠井正信、十市远长等部也趁机展开追击，斩获的首级更是多达两千余。
最后，仅有六角贤永、管秀政、黑川玄蕃左等人带着十余名骑马武士狼狈而逃，河井公左卫门、木户小太郎、美浓部源五、下山甲斐守等六角家家臣皆在逃亡途中被上杉军追上讨取。
上杉军在千贺原之战获胜后，直江景纲率军趁胜追击，兵锋直指菊永城。邻近的织田领大为震动，柴田胜家当即派遣左久间信盛、森可成、进藤贤盛、永原重康等将分别率军进驻长野城、小川城、泷川城、和田城、朝宫城等南近江境目地带的城池兵砦，以防上杉军越过国境攻入近江。
正所谓屋漏偏逢连夜雨。
正当六角义治愈发窘迫之际，尹贺上忍三家（服部家、百地家、藤林家）可不愿意为了六角义治一人付出太大的代价，藤林保丰（藤林正保）、百地泰光（百地正西）、服部保长三人毫不犹豫的抛弃了六角义治，选择向上杉军投降，并愿意充当上杉军的先导役，引导上杉军围攻六角义治所在的菊永城。
有网瘾的牛