尽管南部信直是想开城投降，可手握南部家大权的石龟信房却还想继续负隅顽抗下去。
在石龟信房看来，南部家自从下向北陆奥以后就从来没怕过谁。而上杉军又不是个个天神下凡一般，不可战胜。他就偏偏不信邪，三户城易守难攻，在上杉军攻入三户郡之前就囤积了大量的滚木垒石，守城器械相当充足。
就算曾经南北朝末期，南朝朝廷向足利将军家投降以后，南部家与浪冈北畠家依旧继续与北朝方对抗了一段时间。如今的战局虽然对南部家不利，但是只要拖延时间至冬季，凭借北陆奥的严寒气候，上杉军必然会支撑不住而退兵，届时三户城之围自解。
但现如今的南部家可谓是兵败地失，内外交困，就连三户城的存粮也即将告罄，哪里能坚持到冬季来临？就连主战派的北信爱、石川政信（石川高信次男）、四户满忠（岩崎满忠）等人都认为不应该再坚持继续抵抗下去。
福田喜四郎自从返回三户城后，为了尽可能的削弱三户城守军的战力，就以意图勾结上杉军为名，接连迫害与自己素来不和的三上治部少辅、下田弥三郎（原陆中下田馆馆主）、石鸟谷政友（南部政友）、泽里主膳等诸多南部家家臣使得不少人都对其恨之入骨。
而石龟信房却对福田喜四郎的所作所为听之任之，并不做太多干涉，他反而认为福田喜四郎是值得信赖之人。
北信爱、石川政信、四户满忠等人则是忍无可忍，他们在商议一番后就认为，若是南部家继续这样抵抗下去，那么一旦三户城破，不仅城中协防的领民无法确保他们的安全，就连先前被俘的南部晴政也无法确保上杉家诸将不会迁怒于他。
最后，北信爱、石川政信二人成功说服了南部信直，决定将罪魁祸首之一的石龟信房交出作为筹码，以换得上杉家的谅解。
于是，在南部信直的授意下，北信爱、石川政信二人假意邀请石龟信房至本丸大广间中参加军议，并趁其不备于大广间中暗杀。同时，他们还没有忘记斩草除根，令守将之一的川手田正广（擅长弓术）将石龟信房之子石龟政赖扣上意图谋反的罪名，将其斩首示众。
至于福田喜四郎，他则是在石龟信房、石龟政赖父子二人被杀后，再一次潜出三户城，将南部家权臣石龟信房已死的消息告知上杉氏虎、八条景定、甘糟景持等人。
永禄六年，十月末。
南部信直在换穿一身白衣后，就率家中重臣北信爱、石川政信、四户满忠、东朝政、南盛义等二十余人，到赤石城外投降。
上杉氏虎就率八条景定、甘糟景持、长野业盛、加地春纲等参阵诸将亲自出城受降，而南部信直却趴在地上，战战兢兢，汗流浃背。
“罪臣······罪臣南部大膳大夫信直，参见上杉御史中丞、八条令公······”南部信直根本不敢抬头直视面前不远处的上杉氏虎、八条景定等人。
“起来吧南部大膳大夫。”上杉氏虎平静的说道，他并不打算让南部信直过于难堪。
“罪臣不敢······”南部信直并没有把客气当成福气。